海峽現代農業研究院成立于2011年3月，由中國農業科學院、福建省農業科學院和廈門市政府共同建設，位于環東海域的火炬高新區廈門科技創新園。

總投資15億元的海峽現代農業研究院去年2011年8月注冊成立，位于廈門市科技創新園內，占地113畝，建筑面積30萬平方米，研發與建設由福建省農業科學院、中國農業科學院、臺灣21世紀基金會合作承擔。重點建設創意農業、碳匯經濟、食品加工、精準園藝等4個研發中心，國家對臺農業交流合作基地、兩岸科技與信息交流基地等兩個對臺合作基地以及食品交易所、廈門碳交所等兩個技術交易市場。

海峽現代農業研究院之所以設在廈門，是為了充分利用廈門對外開放窗口的優勢、充分利用福建農科院和中國農科院的人才資源優勢，把海峽現代農研院建設成為展示中國農業科技成就的窗口、引進世界先進農業技術的窗口、研究現代農業科學技術的窗口。他表示，在各方的共同努力下，海峽現代農研院很快將開花結果，為促進廈門、海西，乃至全國的農業科技、生產發展發揮重要作用，實現讓中國農業科技服務世界、讓全世界的農業技術服務中國。