2016年度企業配額實行部分免費發放和部分有償發放，其中，
電力企業的免費配額比例為95%，
鋼鐵、
石化和
水泥企業的免費配額比例為97%。配額有償發放以競價形式發放，控排企業可自主決定是否購買，新建項目企業須在新建項目竣工驗收前購足有償配額。
（一）控排企業配額發放
2016年7月10日至2016年7月20日，控排企業在配額注冊登記系統獲得免費配額。按基準線法分配配額的控排企業，先發預發配額的免費部分，待省發展改革委核定企業配額后，再通過配額注冊登記系統對企業配額差值實行多退少補。
（二）新建項目企業配額發放新建項目企業應按照《廣東省發展改革委關于
碳排放配額管理的實施細則》規定的程序和要求購買有償配額，可從競價發放平臺購買，也可從
市場交易平臺購買。新建項目企業購買足額有償配額并正式轉為控排企業管理后，省發展改革委通過配額注冊登記系統向其發放免費配額。
1.發放數量：2016年度企業有償配額計劃發放200萬噸。當市場出現配額緊缺或價格異常波動的情況下，省發展改革委可動用市場調節配額增加配額有償發放的數量及次數。
2.發放時間：原則上在2016年9月、12月和2017年3月、6月第一個星期安排一期（天）競價發放，具體時間另行公告。
3.發放對象：控排企業、新建項目企業和投資機構。
4.發放底價：申報價格不設限制，但設
政策保留價，作為競價的最低有效價格。
5.發放平臺：符合條件的競價發放平臺。
6.發放流程：省發展改革委委托競價發放平臺負責組織配額有償競價發放工作。企業提交競價購買配額申請、繳納保證金并按規定繳納購買資金后，省發展改革委通過配額注冊登記系統完成配額的交割。
