根據1996年公布的《IPCC清單指南》中關于燃煤電廠脫硫過程中的溫室氣體排放計算方法。燃煤電廠在脫硫時，其二氧化碳排放=燃煤使用量X硫含量X44/32。這種算法的前提是煤炭中的所有硫元素全部燃燒并氧化為二氧化硫，然而在實際情況中，煤炭中的硫元素并沒有全部氧化為二氧化硫，部分硫元素還存在于爐渣與飛灰之中，因此根據此種算法，燃煤電廠的核算排放總量將會大于電廠的實際排放總量。目前在廣東省的《企業二氧化碳排放信息報告指南》中，依然采用了這一算法。

根據2013年，國家發改委公布的《中國發電企業溫室氣體排放核算方法與報告指南(試行)》以及2015年國家標準化委員會公布的《發電行業溫室氣體排放核算與報告要求》中的規定，燃煤電廠脫硫CO2排放量=脫硫劑消耗量×碳酸鹽含量×排放因子×轉化率，根據該公式，只計算了與脫硫劑發生反應的那部分硫元素，即在飛灰爐渣中沒有與脫硫劑發生反應的那部分硫元素不在計算范圍內，因此本方法與IPCC中規定的算法相比更加接近真實值。碳酸鹽排放因子部分，指南與國標的算法也不近相同。例如在指南中碳酸鎂的排放因子為0.552，而在國標中的排放因子為0.522，但目前火電廠所使用的碳酸鹽中，碳酸鎂含量很低，這種差距對結果影響很小。其余的碳酸鹽如碳酸鈉等，其純度更低，產生的碳排放幾乎可以忽略，所以在日常的核查與核算中，這部分排放往往忽略不統計。

2016年1月11日,國家發改委發布了《國家發展改革委辦公廳關于切實做全國碳排放權交易市場啟動重點工作的通知》，同時發布了“補充數據表”。該表格規定了企業溫室氣體排放中參與碳交易的部分，根據該表的內容，輔助及附屬生產的化石燃料消耗和脫硫過程產生的排放不參與交易。也就是說在現階段，雖然企業的溫室氣體排放報告中需要計算脫硫過程的排放，但對于脫硫過程排放的計算不影響企業的交易與履約，但在全國碳交易市場啟動后是否會修改脫硫過程部分的規定，就不得而知了。