據(jù)易碳家了解到，任何一項新的制度的推行必然會與原有制度或者相關制度產(chǎn)生沖突、銜接和融合的問題。每一個制度都有其相對獨立的制度結構，不同的結構決定了其不同的作用機理，其對經(jīng)濟生活也有獨立的作用。

       新制度的引入所帶來的權利義務的再分配必定會對現(xiàn)存制度或者其他相關制度產(chǎn)生影響。這種影響可能是正面的，能夠產(chǎn)生制度融合和互補，進一步提高整體的制度效率；也可能產(chǎn)生制度沖突，帶來的是制度互損和消耗，最終降低整體制度的效率。從制度融合和沖突的視角看，一項有效的制度安排能使制度產(chǎn)生有效融合，最終提高整個經(jīng)濟、社會或者生態(tài)效益。

       碳交易制度的建立作為一項全新的擬制制度，其建立必然會產(chǎn)生與原有的制度和相關制度的沖突。目前主要是碳交易制度和碳稅制度銜接，碳交易制度和清潔發(fā)展機制制度的融合。解決這兩個問題將是碳交易制度效率體現(xiàn)的關鍵。

       碳交易制度和碳稅制度是目前兩種討論比較熱烈的應對氣候變化的制度。很多專家也就中國是該實行碳稅制度還是碳交易制度的問題展開了爭論。這兩個制度在作用機理上存在巨大不同。碳交易制度運用市場交易使資源最大化、成本最小化的原理達到減排的效果。而碳稅則是一種命令—控制式的制度模式，通過政府以征稅的方式增加碳排放的成本，來抑制碳的排放量。兩種制度各有優(yōu)缺點，碳交易制度更能體現(xiàn)成本優(yōu)勢，具有市場推動性，其刺激性更大，但是制度相對復雜，管控、監(jiān)管成本大；碳稅制度直接快速，但缺乏刺激性，企業(yè)在被動接受過程當中，創(chuàng)新和減排動力不足。從國際經(jīng)驗來看，碳交易制度是絕大多數(shù)國家所采取的方式，其在減排的持續(xù)性、刺激性上要明顯強于碳稅制度。但是從實踐來看，碳稅制度完全可以作為碳交易制度的一個有效配套制度。在這一方面英國的氣候變化稅制度值得我國借鑒。

        氣候變化稅是英國“氣候變化計劃”中提出的一項實質(zhì)性政策手段。計稅依據(jù)是使用煤炭、天然氣和電能的數(shù)量。使用可再生能源可減免稅收。其主要目的是提高能源效率和促進節(jié)能減排投資。該稅種一年大約籌措11—12 億英鎊。其中絕大部分以減免社會保險稅的方式返還給企業(yè)，一部分作為節(jié)能投資的補貼，另外一部分歸入碳基金。對于能耗較高的企業(yè)，企業(yè)可與政府協(xié)商達成碳減排協(xié)議，明確到2010 年的減量目標，可減免80%的氣候變化稅。英國這種稅制設置，一是可以通過稅制機理提高能源效率，促進能源結構調(diào)整并最終起到減排作用；但更大的一方面，氣候變化稅作為一種政策工具，可以使得更多企業(yè)參與到碳交易市場中來，承諾減排能減免80%稅收，另外氣候變化籌集的碳基金，可以作為碳交易制度的配套資金，為碳交易制度的檢測、管控、測算提供資金支持，最終促進碳交易制度的完善和高效。

       借鑒英國的經(jīng)驗，中國在開展碳交易制度時可以把碳稅制度作為配套制度。以稅收制度的強制性，加強構建碳交易制度的力度，并增加調(diào)控的張力。

       清潔發(fā)展機制是《京都議定書》中規(guī)定三種減排機制的一種，即發(fā)達國家通過提供資金和技術的方式，通過項目所體現(xiàn)的溫室氣體減排量，可以由發(fā)達國家締約方用于完成在《京都議定書》的減排承諾。中國目前已經(jīng)是世界上最大的CDM容量國家，也是發(fā)達國家爭相爭奪的市場。中國也頒布了《清潔發(fā)展機制項目管理辦法》，規(guī)定實施清潔發(fā)展機制的程序、主管機關、審批機構。盡管存在著價格波動過大、項目周期長、程序復雜等種種問題，但是中國的清潔發(fā)展機制市場也有條不紊地開展著。

       但是清潔發(fā)展機制的原理是發(fā)展中國家和發(fā)達國家之間關于碳排放的貿(mào)易，是一種基于項目的交易。隨著中國國內(nèi)碳交易配額市場的建立，如何銜接這兩個市場將是一個值得研究、同時也是必須解決的問題。

       易碳家認為，清潔發(fā)展機制是《京都議定書》下一種特定的履行方式，在《京都議定書》生效后其存續(xù)性存在質(zhì)疑。同時目前包括歐盟在內(nèi)的碳交易市場對于清潔發(fā)展機制提出了更苛刻的要求，要求開展清潔發(fā)展機制項目的發(fā)展中國家也必須采取相應的減排措施，否則其將不承認從這些國家的清潔發(fā)展機制中獲得碳減排額?？梢娪捎诜N種不確定性，中國的碳減排的重心應是自身國內(nèi)碳交易市場的構建。清潔發(fā)展機制可作為一種輔助措施，以吸收引進發(fā)達國家的先進減排技術。同時在中國碳交易市場相對成熟階段，我國中西部地區(qū)可以開展國內(nèi)的清潔發(fā)展機制。發(fā)達地區(qū)幫助相對落后地區(qū)改進減排技術，提高減排能力，來取得相應的減排配額。這樣最終能使整個區(qū)域達到整體減排的效果。