生態城市建設的指導思想是：以城市生態學和環境經濟學為理論指導，以可持續發展為主題，以城市規劃為藍本，以環境保護為重點，以城市管理為手段，建立政府主導、市場推進、執法監督、公眾參與的新機制，建設經濟、社會、生態三者保持高度和諧的城市。

       生態城市建設的目標是：創建清潔、優美、安靜的城市，全面實現可持續發展。建設高效的生態產業和人們的需求與愿望。得到滿足、和諧的生態文化與功能相整合的生態景觀，實現自然、農業和人居環境的有機結合。

       生態城市建設是人類文明進步的標志，是城市發展的必然方向。它不僅涉及城市物質環境的生態建設、生態恢復，還涉及到價值觀念、生活方式、政策法規等方面。我國是發展中國家，綜合國力、科技水平、人口素質、意識觀念與發達國家相比差距較大。針對環境差、底子薄、人口多的國情，提出以下生態城市建設的對策。

       轉變思想，提高環保和生態意識。從不可持續發展思想向可持續發展思想轉變。其內涵包括：從追求近期的直接經濟效果轉向追求長期的間接經濟效果；從追求單一的經濟高效率轉向追求經濟、生態合并的高效率。這是生態城市建設的思想基礎。沒有這個轉變就不可能有憂患意識、危機感和責任感。這對決策者和企業家尤為重要。因為決策者的思想影響一片，企業家影響一個企業，企業往往是環境污染大戶。我國目前的干部制度是任期制，任期內的績效考核主要還是經濟績效。這很容易使干部產生急功近利的思想。要完成這種思想轉變必須把干部任期內對環境和生態保護的功與過作為績效考核內容之一。

       提高公眾的生態意識，就是使人們認識到自己在自然中所處的位置和應負的環境責任，尊重歷史文化，改變傳統的消費方式，增強自我調節能力，維持城市生態系統的高質量運行。提高公眾的生態意識除了用各種形式加強宣傳和教育外，還應： (1)讓市民親身感受到環境和生態保護帶來的好處；(2)使市民形成“向自然資源索取是有代價的，污染是要付費的”的概念；(3)營造社會公德大環境，規范那些不規范的環境行為。

       加快理論研究，制定生態城市指標體系。現在可持續發展到處都在講。但是，如果沒有能夠指導可持續發展實踐的經濟理論和具體的評價指標，又如何知道決策和實踐是有利于可持續發展的呢?長期以來，城市建設的理論和政策都是重資源開發，以發展國民經濟為主線兼顧市民的基本生活要求。因此，必須針對我國國情建立一套適用于生態城市建設的科學理論和指標體系。

       生態城市應采用整體的系統理論和方法全面系統地理解城市環境、經濟、政治、社會和文化間的相互作用關系。環境經濟學的研究內容已經包括經濟活動的環境效應和生態效應。也有較好的社會基礎，為不少人所接受。政府應積極支持和組織環境經濟學家和相關領域的專家學者探討、研究，使環境經濟學研究的領域擴大，發展成為包括“新財富理論”的多科學、多層次、多分支、交叉性綜合性學科。其領域包括工業經濟學、農業經濟學、森林經濟學、海洋經濟學等以及這些領域的生態經濟學理論。以環境經濟學和城市生態學指導生態城市建設，同時指導國民經濟發展。這是一個機遇，中國應該走在世界前列。

       生態城市建設的目標是多元化的。分解為人口、經濟、社會、環境、生態目標、結構優化目標以及效率公平目標。這些目標又應按生態城市建設的階段(初級、過渡、高級階段)分解為階段性的目標，形成評價指標體系。用它在建設的各個階段來衡量城市生態化速度與變化態勢、能力和協調度。設計的指標應靈敏度高、綜合性強，既有持續性指標、協調性指標，又有監測預警指標。選擇指標的原則應注意因子的綜合性、代表性、層次性、合理性、現實性。在生態城市評價指標體系的指導下來編制城市規劃條例、城市建設條例和城市管理條例。