企業碳排放管理機構是企業碳減排及碳資產管理的執行主體，可以有效貫徹企業低碳戰略并實現企業低碳目標；碳排放和碳資產的經營管理是一項專業化很強的工作，涉及碳排放核算、碳資產管理和交易等專業技術工作，因而要實現企業碳資產的集中有效管理，應建立企業專業化的碳資產和碳排放統一管理機構。統籌低碳發展工作，成立工作領導小組和下屬企業碳排放管理與執行機構，建立自上而下的部門協調機制和反饋機制。分工明確、權責清晰、協調配合是保障碳排放管理體制高效運行的關鍵。應確定機構崗位設置和人員安排，明確相應的職責和權限。其職責主要有：研究制定碳管理相關制度和發展戰略；加強外部溝通，積極與政府相關主管部門溝通，爭取獲得更多配額；開展企業碳盤查試點及普查管理工作，制定企業配額分配方案，研究碳資產管理模式；積極推進企業碳排放權的交易，密切跟蹤國際和國內碳交易市場進展的情況；建立企業碳管理信息系統并維護運行。