在碳金融創新的過程中，不可避免地會遇到一些風險，王倩、黃蕊、雙星(2011)提出面對發達國家在低碳技術、碳金融市場上的領先優勢，及其在碳減排目標單軌制、碳標簽、碳關稅和將高碳產業轉移至發展中國家等方面設置的“低碳陷阱”，發展中國家既不能消極抵抗，也不能盲目遵從。放棄低碳目標，不僅會限制經濟的迸一步發展，還有可能陷入“高碳陷阱”。而盲目地接受發達國家所制定的碳排放、碳金融市場和碳交易核查等相關規則，不僅會承受經濟掠奪，還會因放棄經濟發展權而跌入經濟危機的泥潭。潘小軍(2011)指出碳交易與碳金融活動迅速增長的背后也面臨著一系列制約因素：一是碳金融市場嚴重分割。目前，盡管各國低碳經濟發展模式和水平不同，但國際碳交易和碳金融業務絕大多數集中在發達國家或區域(歐盟)內部，統一的國際市場尚未形成，各國發展極不均衡。二是碳金融發展風險巨大。有關碳排放權的國際公約能否順利延續是未來碳金融發展的最大障礙。三是碳金融市場的微觀主體動力不足。因節能減排初期投入巨大，未來收益既滯后又不確定，嚴重影響當期實際利潤，即使獲得了政府的補貼或減稅優惠，短期行為的微觀主體很難積極主動發展低碳項目。