碳核查是政府行為，核查結果直接影響到了企業當年的碳市場支出成本或收益。由于每個企業的具體情況不同，可能出現的問題也不一樣。做好了碳盤查工作，將發現的問題提前規范和解決，當面對核查機構的時候，就能做到心中有數，澄清核查機構疑問的時候就能夠做到有理有據。目前最顯著和多發的問題就是關于缺省值和實測值的選取問題，如能規范化關鍵數據的檢測和統計，使用實測值，對于大型化石能源使用企業來說，碳排放量至少能夠減少10%以上。