第一，試點地區的主要領導應對配額分配方案的制定和實施給予充分的重視和支持。由于碳交易涉及面廣、牽扯各方主體、利益關系復雜、且影響深遠。碳配額分配方式更是整個碳交易試點關鍵中的關鍵，沒有地區主要領導的決心和支持，很難克服阻力和利益群體的反對，來推出一個符合地方實際、較為公平和有效率、能夠考慮長遠的配額分配方式。目前，許多試點地區主要由發改部門來具體牽頭操作配額分配方案的制定和實施。發改部門作為宏觀協調部門，無疑是合適的機構，然而碳交易的推行涉及各方各面，影響著本地區經濟社會整體的未來發展，應將其納入到地區總體發展戰略中來考慮。因此，最好由試點地區的主要領導來加以總體把握和部署，從而才能夠真正在關鍵的時刻做出關鍵的決定，切實推進配額分配方式的合理制定和實施。

    第二，試點地區需要從只關心配額分配結果的思維定式中跳出來，更為注重如何達到結果的過程。由于每一種配額方式都有自身的優劣，因此每個試點地區都要從實際情況和政策取向出發，選擇和創新一種適合自身需要的配額方式。事實上，針對不同的碳交易試點地區，哪種配額分配方式最為合適，是無法事先預知和設計的，它最終是各個地區在實踐中不斷摸索、總結和調整后的結果。換言之，只有通過各個地區的探索實踐，才能夠更清楚地了解哪些配額方式、哪些制度設計更為適合國內的實際，這也正是國家選擇不同地區開展試點的初衷。因此，對于各個試點地區來說，如何摸索出一套科學合理地制定和實施碳配額分配方案的有效制度，是更為重要的任務。

    第三，試點地區配額分配方案的制定需要做到科學、專業和公開、透明、多方參與的相結合。一方面，要遵循專業、科學的原則。碳配額的分配首先是一個非常專業的科學問題，碳排放如何計量、如何根據地區的長期發展戰略設定合理的配額總量、如何根據地區產業結構特點對不同產業加以區別對待，都需要理性、謹慎地計算和分析。試點地區配額分配方案的制定需要借用外腦、引入相關的專家團隊開展相關的細致研究，從而在此基礎上提出一個盡可能科學合理的方案；另一方面，配額分配方案的制定又不僅僅是個科學問題，它還涉及到各方利益的得失，必然是一個各利益主體討價還價的博弈過程。所以如何保證博弈過程的公開、公正和公平，是配額分配方案制定過程中同樣重要的問題。