CBAM的目的是讓進口產品承擔和歐盟產品相同的排放成本。為了保護歐盟的高能耗/貿易暴露（EITE）產業免受碳泄漏的影響，歐盟向這些行業發放了大量免費排放額度。企業用盡免費額度之后，額外排放才需要負擔成本。在這種情況下，如果對進口產品的排放量全部征收CBAM，就會使歐盟企業獲得雙重保護。因此，流出稿第37節規定，在進口商應繳的CBAM電子憑證數量中，應扣除歐盟同類產品企業獲得的免費排放額度。這可以理解為稅基調整。如下圖所示。

同理，如果進口產品在其生產國已經承擔了一定的排放成本，那么這部分成本也應當扣除。否則，進口產品承擔的排放成本就會高于歐盟同類產品承擔的排放成本，即出現“雙重征稅”問題。因此，流出稿第9節規定，進口商在應繳的CBAM電子憑證數量中，可扣減進口產品在其生產國已實際支付的碳價。這可以理解為稅額抵扣。

值得注意的是，根據歐盟對“碳價”的定義，它只承認以碳稅或排放額度形式存在的、可量化的碳價。對于此類碳價，歐盟可與第三國通過協商，分行業達成共識。另一方面，碳稅和排放額度之外的其他政策措施雖然也會使企業承擔隱形排放成本，但歐盟并不承認這種難以量化的碳價。