歐盟碳排放交易體系試驗(yàn)階段的主要目的是發(fā)現(xiàn)并彌補(bǔ)設(shè)計(jì)缺陷、積累運(yùn)行總量交易機(jī)制的經(jīng)驗(yàn)。針對(duì)排放交易體系試驗(yàn)階段中所暴露出的問題，歐盟對(duì)其進(jìn)行了改進(jìn)，使其更加完善。這些缺陷及其改進(jìn)措施主要在三個(gè)方面。

一是排放權(quán)發(fā)放超過實(shí)際排放量問題。例如，在2005 年，所發(fā)放的排放權(quán)超過實(shí)際排放量4%，沒有一個(gè)產(chǎn)業(yè)的排放權(quán)處于短缺狀態(tài)，鋼鐵、造紙、陶瓷和廚具部門的排放權(quán)發(fā)放量甚至超過實(shí)際排放量的20%。排放權(quán)總量過多，導(dǎo)致排放權(quán)價(jià)格下降，環(huán)境約束軟化，企業(yè)失去采取措施降低二氧化碳排放的積極性。針對(duì)這個(gè)問題，歐盟在排放體系實(shí)施的第二階段，下調(diào)了年排放權(quán)總量。調(diào)整后的年排放權(quán)平均比2005 年低6%。

二是排放權(quán)免費(fèi)分配問題。第一階段排放權(quán)是免費(fèi)發(fā)放給企業(yè)的，并且電力行業(yè)發(fā)放過多，結(jié)果電力行業(yè)并沒有用排放權(quán)抵免實(shí)際排放量，而是把排放權(quán)放到市場上出售，獲取暴利。在第二階段，政府提高了許可權(quán)拍賣的比例，并降低了電力部門的發(fā)放上限，迫使電力企業(yè)采取措施降低碳排放。

三是微觀數(shù)據(jù)的缺失問題。歐盟排放交易體系試運(yùn)行時(shí)，工廠層次上的二氧化碳的排放數(shù)據(jù)是不存在的，排放權(quán)只能根據(jù)估計(jì)發(fā)放給企業(yè)，由此排放權(quán)發(fā)放過多、市場價(jià)格大幅波動(dòng)等諸多問題。但歐盟利用三年試驗(yàn)期，不斷地收集、修正企業(yè)層次上的碳排放的數(shù)據(jù)，現(xiàn)已建立龐大的能支持歐盟決策的關(guān)于企業(yè)碳排放的數(shù)據(jù)庫。