雖然近年來我國各大商業銀行爭相試水碳金融業務勢不可擋，但是商業銀行本身在開展業務的同時受到如下因素制約。

CDM項目合規性不足。碳金融中，我國商業銀行參與程度最高的市場即CDM市場，但2009年CDM理事會共召開7次會議，拒絕了30個來自中國的CDM項目注冊。據CDM公開資料顯示，目前在CDM注冊的項目數達1946個，自2006年7月以來，共137個項目遭拒，其中一半是來自中國、印度和巴西的項目。這充分說明我國立項項目在合規性方面存在普遍不足，需要商業銀行積極開展中介服務業務應對挑戰。

一二級市場CER存在價差。由于中國作為《京都議定書》的參與者，承擔共同但有區別的責任，不承擔絕對減排義務。所以我國在全球碳交易市場中處于純粹賣方的地位。在CER價格上，中國限價為8歐元/噸，近年來實際成交價在10歐元/噸左右，但歐洲氣候交易所公布的二級市場上CER再出售的價格達12歐元/噸以上，特別在2008年9月更高達21歐元/噸。可見，一二級市場上CER交易存在著巨大利潤空間，這必將引導我國商業銀行進行必要的業務創新。

后京都議定書時代的政策風險?！毒┒甲h定書》的第一個減排承諾將于2012年結束，屆時隨著后京都時代的到來，國際上具體的制度安排，包括我國在全球碳金融領域中的角色定位都存在著極大不確定性。這些政策風險將直接制約我國商業銀行開展碳金融業務的積極性。