碳市場和電力市場形成的根源不同，市場運作通常是彼此獨立的，是相對獨立的兩個市場。形成根源上，碳市場屬于政策形成市場，主要形成目的是為了助力國家碳減排目標；而電力市場是需求驅動市場，主要是為了滿足電力供需方的需求，合理地配置電能資源。市場運作方面，未來隨著碳達峰、碳中和目標的逐步實現，碳排放量逐漸減少，未來碳市場空間要求逐漸收縮；隨著電力體制改革的深入，電力市場化交易比重日益提高，改革紅利逐步釋放，電力市場空間要求逐漸擴展。

對電力企業來說，發電的同時伴隨著碳排放，電力市場和碳市場存在一定關聯，具有共同特征。一是兩個市場有共同的參與主體，發電企業同時參與兩個市場，將對其發電決策和投資行為產生影響。二是兩個市場有共同的建設思路，都在建設全國統一市場。三是兩個市場有共同的設計理念，均以統一規則為基礎，強調頂層設計。四是兩個市場有共同的功能作用，都將促進清潔能源發展，促進資源大范圍配置。