向海洋生態系統中排出的污染物在很大程度上破壞了原有的海洋生態，導致了當前海岸經常出現的富營養化等海洋生態的破壞性變化。減少海洋環境污染可以作為一種幫助海洋環境恢復，增加海洋生態碳匯能力的實施手段。海洋碳匯工程可以分解為若干個減少污染物排放的海洋環境保護工程。相比于海洋污染物的檢測，海洋碳匯能力的恢復可能需要更長時間，但海洋碳匯工程實施后的效果具有可觀的碳匯前景。