作為歐盟氣候法的基石，EU ETS的最終目標在于以效益最大化的市場手段實現碳減排的環保目標。因此，減排目標與總量設定作為EU ETS法律框架的第一個關鍵要素，將決定EU ETS能否充分和有效實現其環保目標。

    EU ETS的目標設定由歐盟氣候政策和排放交易類型所決定。一方面，歐盟氣候政策的碳減排目標是國際談判以及單方面承諾的結果。另外一方面，EU ETS自其建立以來采用總量—交易(cap-and-trade)模式，其碳減排目標以總量控制目標(cap)的形式出現。而且，這個總量目標既是即將發售的配額總量，也是在未來交易期限中獲允許的碳排放總量。